Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms