Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms