Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms