Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms