Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms