Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms