Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms