Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms