Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT140Q96RY7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT140Q96RY7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT140Q96RY7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT140Q96RY7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT140Q96RY7 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT140Q96RY7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT140Q96RY7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT140Q96RY7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT140Q96RY7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT140Q96RY7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT140Q96RY7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT140Q96RY7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT140Q96RY7 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT140Q96RY7 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT140Q96RY7 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT140Q96RY7 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT140Q96RY7 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT140Q96RY7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT140Q96RY7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT140Q96RY7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms