Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms