Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC11Q96DB2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms