Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms