Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A3Q93084 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms