Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP9XQ93008 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
USP9XQ93008 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
USP9XQ93008 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
USP9XQ93008 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.08■□□□□ 0
USP9XQ93008 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP9XQ93008 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP9XQ93008 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP9XQ93008 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USP9XQ93008 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP9XQ93008 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP9XQ93008 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP9XQ93008 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP9XQ93008 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP9XQ93008 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP9XQ93008 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP9XQ93008 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USP9XQ93008 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
USP9XQ93008 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USP9XQ93008 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USP9XQ93008 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USP9XQ93008 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP9XQ93008 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USP9XQ93008 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP9XQ93008 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USP9XQ93008 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP9XQ93008 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP9XQ93008 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP9XQ93008 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP9XQ93008 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USP9XQ93008 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP9XQ93008 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
USP9XQ93008 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP9XQ93008 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USP9XQ93008 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP9XQ93008 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP9XQ93008 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP9XQ93008 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
USP9XQ93008 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP9XQ93008 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
USP9XQ93008 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
USP9XQ93008 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP9XQ93008 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP9XQ93008 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USP9XQ93008 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP9XQ93008 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP9XQ93008 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP9XQ93008 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
USP9XQ93008 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
USP9XQ93008 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USP9XQ93008 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
USP9XQ93008 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.06■□□□□ 0
USP9XQ93008 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.06■□□□□ 0
USP9XQ93008 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.06■□□□□ 0
USP9XQ93008 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
USP9XQ93008 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP9XQ93008 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP9XQ93008 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP9XQ93008 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
USP9XQ93008 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
USP9XQ93008 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USP9XQ93008 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
USP9XQ93008 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms