Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHIPQ8WWQ0 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PHIPQ8WWQ0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms