Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms