Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF248Q8NDW4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms