Protein–RNA interactions for Protein: Q8N239

KLHL34, Kelch-like protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL34Q8N239 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL34Q8N239 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms