Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC117Q8IWD4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms