Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLD3Q8IV08 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLD3Q8IV08 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLD3Q8IV08 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLD3Q8IV08 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLD3Q8IV08 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLD3Q8IV08 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLD3Q8IV08 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLD3Q8IV08 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLD3Q8IV08 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLD3Q8IV08 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLD3Q8IV08 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PLD3Q8IV08 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PLD3Q8IV08 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PLD3Q8IV08 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PLD3Q8IV08 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLD3Q8IV08 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLD3Q8IV08 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms