Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms