Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms