Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SSH2Q76I76 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms