Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF493Q6ZR52 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms