Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC174Q6PII3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms