Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MED27Q6P2C8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MED27Q6P2C8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MED27Q6P2C8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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