Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3F3CQ6NXT2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms