Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms