Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms