Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms