Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF8Q3BBV2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF8Q3BBV2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF8Q3BBV2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF8Q3BBV2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF8Q3BBV2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF8Q3BBV2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF8Q3BBV2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF8Q3BBV2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF8Q3BBV2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF8Q3BBV2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF8Q3BBV2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF8Q3BBV2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF8Q3BBV2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms