Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms