Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms