Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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