Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms