Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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