Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms