Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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