Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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