Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms