Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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