Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NWD1Q149M9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NWD1Q149M9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms