Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms