Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms