Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms