Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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GBX1Q14549 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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GBX1Q14549 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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GBX1Q14549 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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