Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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BECN1Q14457 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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BECN1Q14457 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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BECN1Q14457 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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BECN1Q14457 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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BECN1Q14457 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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BECN1Q14457 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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BECN1Q14457 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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