Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF1Q14162 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF1Q14162 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF1Q14162 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF1Q14162 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF1Q14162 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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