Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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DDX39BQ13838 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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DDX39BQ13838 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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DDX39BQ13838 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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DDX39BQ13838 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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DDX39BQ13838 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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DDX39BQ13838 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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DDX39BQ13838 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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DDX39BQ13838 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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DDX39BQ13838 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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DDX39BQ13838 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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DDX39BQ13838 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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DDX39BQ13838 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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