Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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